Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NUP62P37198 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NUP62P37198 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP62P37198 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP62P37198 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms