Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHI3L1P36222 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHI3L1P36222 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms