Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GPC1P35052 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPC1P35052 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPC1P35052 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GPC1P35052 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC1P35052 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC1P35052 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC1P35052 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC1P35052 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC1P35052 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC1P35052 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC1P35052 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC1P35052 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC1P35052 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC1P35052 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC1P35052 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC1P35052 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC1P35052 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC1P35052 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC1P35052 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC1P35052 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC1P35052 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC1P35052 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC1P35052 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GPC1P35052 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GPC1P35052 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GPC1P35052 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPC1P35052 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPC1P35052 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPC1P35052 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPC1P35052 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GPC1P35052 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPC1P35052 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPC1P35052 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPC1P35052 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GPC1P35052 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms