Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CNGA1P29973 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms