Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCKSP29966 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms