Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD40LGP29965 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms