Protein–RNA interactions for Protein: P28068

HLA-DMB, HLA class II histocompatibility antigen, DM beta chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMBP28068 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DMBP28068 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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