Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-DMAP28067 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-DMAP28067 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms