Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PSMB9P28065 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PSMB9P28065 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms