Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4AP27815 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE4AP27815 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE4AP27815 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE4AP27815 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4AP27815 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4AP27815 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4AP27815 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4AP27815 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4AP27815 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4AP27815 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4AP27815 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4AP27815 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4AP27815 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4AP27815 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4AP27815 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4AP27815 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4AP27815 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4AP27815 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4AP27815 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4AP27815 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4AP27815 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
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