Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM21P19474 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM21P19474 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM21P19474 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM21P19474 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM21P19474 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM21P19474 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM21P19474 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM21P19474 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM21P19474 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM21P19474 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM21P19474 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM21P19474 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM21P19474 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM21P19474 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM21P19474 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM21P19474 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM21P19474 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM21P19474 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM21P19474 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM21P19474 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM21P19474 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM21P19474 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM21P19474 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM21P19474 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM21P19474 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM21P19474 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM21P19474 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM21P19474 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM21P19474 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM21P19474 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM21P19474 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms