Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRAFP15056 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRAFP15056 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BRAFP15056 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BRAFP15056 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
BRAFP15056 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRAFP15056 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRAFP15056 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRAFP15056 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRAFP15056 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRAFP15056 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRAFP15056 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRAFP15056 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRAFP15056 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRAFP15056 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BRAFP15056 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRAFP15056 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRAFP15056 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BRAFP15056 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRAFP15056 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRAFP15056 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRAFP15056 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRAFP15056 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRAFP15056 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRAFP15056 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BRAFP15056 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BRAFP15056 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BRAFP15056 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRAFP15056 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRAFP15056 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRAFP15056 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRAFP15056 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRAFP15056 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRAFP15056 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRAFP15056 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRAFP15056 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRAFP15056 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BRAFP15056 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms