Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 AC133485.6-201ENST00000624045 688 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXB1P14653 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms