Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF35P13682 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms