Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GLI4P10075 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GLI4P10075 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GLI4P10075 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GLI4P10075 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GLI4P10075 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GLI4P10075 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GLI4P10075 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms