Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RGPD2P0DJD1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RGPD2P0DJD1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms