Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTXN2P0C2S0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms