Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NGFRP08138 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NGFRP08138 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NGFRP08138 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NGFRP08138 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NGFRP08138 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NGFRP08138 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NGFRP08138 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NGFRP08138 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NGFRP08138 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NGFRP08138 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NGFRP08138 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NGFRP08138 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NGFRP08138 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NGFRP08138 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NGFRP08138 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NGFRP08138 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NGFRP08138 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NGFRP08138 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NGFRP08138 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NGFRP08138 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NGFRP08138 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NGFRP08138 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NGFRP08138 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NGFRP08138 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NGFRP08138 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NGFRP08138 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NGFRP08138 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NGFRP08138 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NGFRP08138 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NGFRP08138 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NGFRP08138 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NGFRP08138 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NGFRP08138 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NGFRP08138 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NGFRP08138 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NGFRP08138 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NGFRP08138 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NGFRP08138 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NGFRP08138 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NGFRP08138 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NGFRP08138 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NGFRP08138 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NGFRP08138 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NGFRP08138 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NGFRP08138 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NGFRP08138 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NGFRP08138 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NGFRP08138 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NGFRP08138 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NGFRP08138 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NGFRP08138 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NGFRP08138 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NGFRP08138 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NGFRP08138 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NGFRP08138 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NGFRP08138 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NGFRP08138 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NGFRP08138 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms