Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MYCNP04198 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MYCNP04198 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYCNP04198 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYCNP04198 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYCNP04198 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYCNP04198 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYCNP04198 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYCNP04198 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYCNP04198 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYCNP04198 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYCNP04198 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYCNP04198 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYCNP04198 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MYCNP04198 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYCNP04198 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYCNP04198 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYCNP04198 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYCNP04198 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MYCNP04198 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYCNP04198 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYCNP04198 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYCNP04198 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNP04198 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNP04198 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNP04198 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNP04198 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNP04198 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNP04198 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNP04198 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNP04198 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNP04198 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNP04198 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNP04198 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNP04198 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNP04198 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNP04198 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNP04198 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNP04198 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNP04198 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNP04198 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNP04198 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNP04198 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYCNP04198 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYCNP04198 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYCNP04198 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYCNP04198 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYCNP04198 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYCNP04198 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYCNP04198 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYCNP04198 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYCNP04198 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYCNP04198 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MYCNP04198 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MYCNP04198 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYCNP04198 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MYCNP04198 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYCNP04198 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYCNP04198 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYCNP04198 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYCNP04198 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYCNP04198 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYCNP04198 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYCNP04198 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYCNP04198 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYCNP04198 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYCNP04198 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYCNP04198 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYCNP04198 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYCNP04198 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYCNP04198 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYCNP04198 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MYCNP04198 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYCNP04198 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYCNP04198 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MYCNP04198 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYCNP04198 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MYCNP04198 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYCNP04198 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYCNP04198 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYCNP04198 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCNP04198 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCNP04198 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCNP04198 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCNP04198 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCNP04198 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCNP04198 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCNP04198 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MYCNP04198 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms