Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
F9P00740 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
F9P00740 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
F9P00740 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
F9P00740 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
F9P00740 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
F9P00740 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
F9P00740 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
F9P00740 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
F9P00740 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
F9P00740 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
F9P00740 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
F9P00740 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
F9P00740 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
F9P00740 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
F9P00740 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
F9P00740 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
F9P00740 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
F9P00740 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
F9P00740 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
F9P00740 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
F9P00740 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
F9P00740 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
F9P00740 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
F9P00740 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
F9P00740 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
F9P00740 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
F9P00740 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
F9P00740 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
F9P00740 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
F9P00740 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
F9P00740 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
F9P00740 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
F9P00740 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
F9P00740 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
F9P00740 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
F9P00740 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
F9P00740 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
F9P00740 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
F9P00740 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
F9P00740 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
F9P00740 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
F9P00740 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
F9P00740 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
F9P00740 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
F9P00740 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
F9P00740 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
F9P00740 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
F9P00740 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
F9P00740 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
F9P00740 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
F9P00740 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
F9P00740 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
F9P00740 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
F9P00740 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
F9P00740 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
F9P00740 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
F9P00740 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
F9P00740 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
F9P00740 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
F9P00740 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
F9P00740 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
F9P00740 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
F9P00740 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
F9P00740 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
F9P00740 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
F9P00740 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
F9P00740 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
F9P00740 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
F9P00740 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
F9P00740 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
F9P00740 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
F9P00740 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
F9P00740 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
F9P00740 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms