Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC24BO95487 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms