Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRATO95237 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRATO95237 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRATO95237 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRATO95237 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRATO95237 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRATO95237 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRATO95237 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRATO95237 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRATO95237 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRATO95237 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRATO95237 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRATO95237 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LRATO95237 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRATO95237 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRATO95237 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRATO95237 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRATO95237 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRATO95237 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRATO95237 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRATO95237 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRATO95237 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRATO95237 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRATO95237 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRATO95237 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRATO95237 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRATO95237 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRATO95237 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRATO95237 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRATO95237 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRATO95237 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRATO95237 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRATO95237 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRATO95237 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRATO95237 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRATO95237 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRATO95237 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRATO95237 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRATO95237 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LRATO95237 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRATO95237 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRATO95237 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRATO95237 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRATO95237 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LRATO95237 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRATO95237 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRATO95237 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRATO95237 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRATO95237 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRATO95237 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRATO95237 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRATO95237 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRATO95237 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRATO95237 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRATO95237 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRATO95237 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRATO95237 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRATO95237 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRATO95237 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRATO95237 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRATO95237 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRATO95237 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRATO95237 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRATO95237 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRATO95237 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRATO95237 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRATO95237 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRATO95237 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRATO95237 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRATO95237 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRATO95237 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRATO95237 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRATO95237 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRATO95237 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRATO95237 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRATO95237 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRATO95237 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRATO95237 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRATO95237 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRATO95237 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRATO95237 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRATO95237 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRATO95237 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRATO95237 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRATO95237 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRATO95237 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRATO95237 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRATO95237 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRATO95237 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRATO95237 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRATO95237 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRATO95237 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRATO95237 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRATO95237 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms