Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCNKO75909 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCNKO75909 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNKO75909 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNKO75909 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNKO75909 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNKO75909 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNKO75909 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNKO75909 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNKO75909 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNKO75909 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNKO75909 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNKO75909 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNKO75909 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNKO75909 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNKO75909 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNKO75909 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNKO75909 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNKO75909 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNKO75909 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNKO75909 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNKO75909 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNKO75909 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNKO75909 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNKO75909 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNKO75909 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNKO75909 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCNKO75909 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCNKO75909 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms