Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRMUO75648 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRMUO75648 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRMUO75648 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRMUO75648 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRMUO75648 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRMUO75648 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRMUO75648 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRMUO75648 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMUO75648 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMUO75648 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMUO75648 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMUO75648 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMUO75648 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMUO75648 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMUO75648 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMUO75648 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMUO75648 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMUO75648 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMUO75648 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMUO75648 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMUO75648 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMUO75648 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMUO75648 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMUO75648 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMUO75648 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMUO75648 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMUO75648 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMUO75648 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMUO75648 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMUO75648 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMUO75648 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMUO75648 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRMUO75648 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRMUO75648 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRMUO75648 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms