Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 IGSF8-204ENST00000460351 876 ntTSL 216.51■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MAP7D3-202ENST00000370660 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)16.51■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SEPT9-210ENST00000585929 906 ntTSL 416.49■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RAD51AP1-207ENST00000536346 707 ntTSL 216.48■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF687-202ENST00000336715 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)16.47■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CCNDBP1-213ENST00000568507 1385 ntTSL 216.46■□□□□ 0.232e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 APBA3-205ENST00000590064 4250 ntTSL 1 (best)16.46■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 IL4R-214ENST00000565696 533 ntTSL 316.45■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LMBR1L-202ENST00000417750 2334 ntTSL 216.45■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.222e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NECTIN2-206ENST00000592018 812 ntTSL 316.44■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 BARD1-204ENST00000455743 2261 ntTSL 516.43■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LMAN2L-207ENST00000449221 1061 ntTSL 216.43■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LMAN2L-205ENST00000440610 1008 ntTSL 216.43■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PLK3-206ENST00000492398 1135 ntTSL 316.43■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SH3TC1-210ENST00000506360 5829 ntTSL 216.41■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SEMA4B-208ENST00000559074 1697 ntTSL 216.41■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ABI2-210ENST00000417864 1567 ntTSL 1 (best)16.39■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AP4M1-209ENST00000445208 1681 ntTSL 516.33■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MTA1-215ENST00000494981 509 ntTSL 316.32■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PRR14-204ENST00000563211 786 ntTSL 516.28■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF687-205ENST00000443959 893 ntTSL 1 (best)16.27■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 BLVRA-203ENST00000424330 443 ntTSL 316.27■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ALG1L13P-203ENST00000522393 550 ntTSL 416.24■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NUMB-213ENST00000554818 552 ntTSL 316.23■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TBC1D9B-218ENST00000522921 557 ntTSL 316.22■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 HGS-202ENST00000570355 735 ntTSL 516.2■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ABI2-217ENST00000431886 580 ntTSL 416.19■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SFXN5-204ENST00000416579 895 ntTSL 316.19■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FAM3A-219ENST00000492763 587 ntTSL 316.18■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FAM3A-209ENST00000421517 853 ntTSL 316.18■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ABCB8-208ENST00000470645 1722 ntTSL 216.17■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MAEA-220ENST00000515766 3136 ntTSL 216.16■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PTGES2-213ENST00000497109 684 ntTSL 516.15■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 HNRNPR-211ENST00000490652 612 ntTSL 216.14■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PLEKHM1-202ENST00000446609 2825 ntTSL 516.12■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ALDH2-203ENST00000548536 1760 ntTSL 316.12■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 POLR2E-203ENST00000586215 756 ntTSL 216.11■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.165e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SNCG-204ENST00000483064 794 ntTSL 216.07■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ACADM-204ENST00000473018 579 ntTSL 216.04■□□□□ 0.162e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 HGS-206ENST00000571647 2401 nt16.04■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 HPS1-214ENST00000498219 845 ntTSL 516.01■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AGBL2-209ENST00000529712 2617 ntTSL 215.97■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ENGASE-209ENST00000584568 448 ntTSL 515.96■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 HPS1-205ENST00000414009 857 ntTSL 215.96■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NOP58-208ENST00000488403 871 ntTSL 215.95■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FUK-206ENST00000571487 1629 ntTSL 515.95■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CENPT-219ENST00000565385 573 ntTSL 415.94■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 BID-207ENST00000494097 2429 ntTSL 1 (best)15.94■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NOP58-202ENST00000426814 655 ntTSL 215.92■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CCDC57-214ENST00000582040 330 ntTSL 315.91■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 137.9
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1323.6 ms