Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NIPSNAP2O75323 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP2O75323 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms