Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB11FIP3O75154 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms