Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTIFO43310 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTIFO43310 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTIFO43310 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTIFO43310 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CTIFO43310 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTIFO43310 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CTIFO43310 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTIFO43310 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTIFO43310 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTIFO43310 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTIFO43310 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTIFO43310 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTIFO43310 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTIFO43310 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTIFO43310 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTIFO43310 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CTIFO43310 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTIFO43310 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTIFO43310 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTIFO43310 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTIFO43310 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTIFO43310 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTIFO43310 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTIFO43310 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTIFO43310 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTIFO43310 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTIFO43310 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTIFO43310 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CTIFO43310 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CTIFO43310 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTIFO43310 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTIFO43310 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTIFO43310 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTIFO43310 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTIFO43310 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTIFO43310 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTIFO43310 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTIFO43310 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTIFO43310 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTIFO43310 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTIFO43310 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTIFO43310 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTIFO43310 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTIFO43310 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTIFO43310 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTIFO43310 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTIFO43310 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTIFO43310 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CTIFO43310 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTIFO43310 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTIFO43310 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CTIFO43310 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CTIFO43310 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTIFO43310 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTIFO43310 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CTIFO43310 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTIFO43310 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTIFO43310 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTIFO43310 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTIFO43310 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTIFO43310 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTIFO43310 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTIFO43310 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTIFO43310 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTIFO43310 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTIFO43310 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTIFO43310 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTIFO43310 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTIFO43310 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTIFO43310 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTIFO43310 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTIFO43310 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
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