Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CRXO43186 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CRXO43186 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CRXO43186 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms