Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MEFVO15553 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MEFVO15553 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MEFVO15553 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MEFVO15553 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MEFVO15553 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MEFVO15553 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MEFVO15553 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MEFVO15553 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEFVO15553 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEFVO15553 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEFVO15553 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MEFVO15553 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEFVO15553 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEFVO15553 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEFVO15553 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEFVO15553 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MEFVO15553 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEFVO15553 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEFVO15553 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEFVO15553 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEFVO15553 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MEFVO15553 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MEFVO15553 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MEFVO15553 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEFVO15553 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEFVO15553 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEFVO15553 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEFVO15553 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEFVO15553 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEFVO15553 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEFVO15553 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MEFVO15553 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEFVO15553 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEFVO15553 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEFVO15553 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEFVO15553 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MEFVO15553 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEFVO15553 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEFVO15553 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEFVO15553 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEFVO15553 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEFVO15553 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEFVO15553 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEFVO15553 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEFVO15553 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEFVO15553 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEFVO15553 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEFVO15553 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEFVO15553 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEFVO15553 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEFVO15553 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MEFVO15553 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms