Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARPC5O15511 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARPC5O15511 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms