Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
E9PBE3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E9PBE3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
E9PBE3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E9PBE3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms