Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC69A6NI79 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms