Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF25A6NGN4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms