Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA6BA6NDN3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms