Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00862A6NCI5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms