Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf170A2RU37 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms