Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 AGBL1-205ENST00000635782 3201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC027801.2-201ENST00000515692 1816 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PIWIL4-201ENST00000299001 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF2-202ENST00000313695 4080 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CNKSR2-201ENST00000279451 4478 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BDNF-218ENST00000533246 4000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PAFAH2-201ENST00000374282 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPS1-209ENST00000519674 3116 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM33-202ENST00000325094 6221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 WWC2-209ENST00000513834 4887 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF549-201ENST00000240719 3969 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AP002748.4-201ENST00000419755 3547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TWISTNB-201ENST00000222567 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 VSIG4-204ENST00000455586 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KLK10-203ENST00000391805 3006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MORC2-202ENST00000397641 5181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAMTSL3-201ENST00000286744 7336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TMPRSS4-218ENST00000534111 5550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KIFAP3-201ENST00000361580 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PAEP-202ENST00000371766 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK12-202ENST00000395778 605 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HBA2-202ENST00000397806 513 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC245052.2-201ENST00000413723 327 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL359510.1-201ENST00000413855 208 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL121999.1-201ENST00000420156 332 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MT1XP1-201ENST00000421314 186 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL353572.2-201ENST00000427728 748 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CIDECP-205ENST00000433871 770 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP2C58P-201ENST00000436281 475 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005517.1-201ENST00000452091 489 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL151P-201ENST00000460537 283 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL743P-201ENST00000475032 298 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL822P-201ENST00000475674 296 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL79P-201ENST00000484117 290 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC114964.1-201ENST00000502306 1111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC097467.2-201ENST00000502884 346 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC026785.1-201ENST00000505520 580 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091180.2-203ENST00000507337 601 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL589743.2-201ENST00000547821 602 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009065.7-201ENST00000561544 580 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ACTG1P16-201ENST00000564713 1082 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092120.2-201ENST00000567166 415 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011840.3-201ENST00000579378 280 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091027.1-201ENST00000580639 523 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC021534.1-201ENST00000583980 547 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000894.1-201ENST00000584430 520 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004134.1-201ENST00000587835 225 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005387.2-201ENST00000596596 440 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL803P-201ENST00000607433 307 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC007450.4-201ENST00000614709 524 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BSNDP2-201ENST00000621945 366 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC243547.3-202ENST00000625258 192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC083841.4-201ENST00000637396 352 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 EFTUD2-223ENST00000592576 3364 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 L3MBTL1-202ENST00000373134 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms