Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 TDRD3-208ENST00000535286 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 ZEB2-224ENST00000539609 4061 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 SVILP1-201ENST00000422642 2676 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 SCNN1G-201ENST00000300061 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AGBL3-203ENST00000436302 3533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 GABRA2-201ENST00000356504 2770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 CTNNA2-217ENST00000540488 2792 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 DEPDC5-201ENST00000382111 5212 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AL589935.1-204ENST00000423255 407 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AL161447.1-201ENST00000427811 230 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 GUSBP2-203ENST00000492832 801 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 ZBED3-AS1-203ENST00000504506 702 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 NDUFA3P4-201ENST00000560814 250 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 UBBP4-201ENST00000583708 689 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AC087645.1-201ENST00000588528 291 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AC091132.5-201ENST00000590995 560 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 KRTAP10-12-202ENST00000618832 282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AP000356.4-201ENST00000639500 172 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 MCTP1-202ENST00000429576 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 SYNPR-201ENST00000295894 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 PSMF1-202ENST00000333082 3686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 NUP210L-203ENST00000368559 5889 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 DAZ2-207ENST00000382449 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 ZNF3-207ENST00000424697 2718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AC092132.2-201ENST00000611227 2744 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 CD44-208ENST00000428726 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 PABPC1P4-201ENST00000539977 1875 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
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HOXD11P31277 SORBS1-201ENST00000277982 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
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HOXD11P31277 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
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HOXD11P31277 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 DEPDC5-204ENST00000400246 5551 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 PTAFR-203ENST00000539896 4191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 LMO3-204ENST00000354662 3574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AKNAD1-203ENST00000370001 3053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 LINC01234-202ENST00000547963 2088 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
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HOXD11P31277 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 LINC01644-201ENST00000405369 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
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HOXD11P31277 RPS29P3-201ENST00000439929 171 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 CYP4F25P-201ENST00000446871 520 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 LINC01007-203ENST00000451953 579 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AC079944.1-201ENST00000485426 495 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
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HOXD11P31277 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
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HOXD11P31277 IGLVI-68-201ENST00000519525 345 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 TMEM132D-AS1-206ENST00000541320 440 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 TMEM132D-AS1-207ENST00000542535 442 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AL137230.2-201ENST00000555070 452 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 CDRT8-201ENST00000579752 467 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 RPL27-205ENST00000589037 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 TMEM144-201ENST00000296529 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 CACNA1D-202ENST00000350061 7636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 MTMR10-201ENST00000435680 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 NAIP-208ENST00000517649 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 MTMR4-201ENST00000323456 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 CELF2-202ENST00000399850 7085 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 COL4A6-202ENST00000372216 6570 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 MOBP-201ENST00000311042 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
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