Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 CLPS-203ENST00000622413 461 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 MAGOHB-211ENST00000625272 319 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 ZNF728-201ENST00000594710 2015 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 NSRP1-201ENST00000247026 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AC079331.2-201ENST00000623462 2546 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 NELL2-212ENST00000549027 3036 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 ZMYND8-204ENST00000355972 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 C10orf53-202ENST00000374112 2130 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 ACOT9-204ENST00000379303 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 PPFIBP2-216ENST00000530181 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 SLITRK3-202ENST00000475390 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 KPNA7-201ENST00000327442 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AC083902.2-201ENST00000511828 10086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 MED23-202ENST00000368053 2811 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 TRPM8-204ENST00000433712 5291 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 BORA-203ENST00000390667 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 CEP68-205ENST00000537589 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 DMP1-202ENST00000339673 2682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 TUBA1A-202ENST00000301071 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 MID1-212ENST00000616003 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 PAXIP1-201ENST00000397192 3711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 SYNJ1-201ENST00000357345 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 SYNJ1-203ENST00000382499 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 EYA4-213ENST00000531901 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 ATP9A-201ENST00000311637 7437 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 FTX-215ENST00000638681 9771 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 C1orf87-201ENST00000371201 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AC005005.3-201ENST00000609017 1410 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 C1QTNF3-AMACR-201ENST00000382079 3424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 CPNE4-210ENST00000512332 2230 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 TM2D2-203ENST00000456845 3295 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 ADGRF5-202ENST00000283296 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 TFRC-201ENST00000360110 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 KDM4C-205ENST00000428870 3039 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 GLDCP1-201ENST00000510885 2678 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AC008498.2-201ENST00000624033 2322 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 BCO2-208ENST00000526088 1983 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 PHF19-214ENST00000616568 4159 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 ARMCX7P-201ENST00000372828 562 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AL021707.4-201ENST00000423346 410 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 PAX8-AS1-208ENST00000456685 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AC025437.1-201ENST00000523820 346 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 LRTOMT-212ENST00000536917 579 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 MIR6083-201ENST00000612737 106 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 GNAS-AS1_2.1-201ENST00000613404 114 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 BSN-201ENST00000296452 15955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 CHURC1-203ENST00000549115 2629 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AC009336.3-201ENST00000623777 2620 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 ZNF286A-221ENST00000593105 5222 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 GPBP1L1-202ENST00000355105 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 CLTCL1-202ENST00000427926 5513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 SBF2-201ENST00000256190 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 CYP27C1-201ENST00000335247 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 TRPV1-202ENST00000399756 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 ATP8A2-204ENST00000381655 9575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 LDB2-201ENST00000304523 2548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 C9orf84-202ENST00000374283 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 SLC22A2-201ENST00000366952 3737 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 SHTN1-207ENST00000615301 6730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 GRIA2-211ENST00000507898 3041 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 F11-203ENST00000403665 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 SLC15A1-202ENST00000376503 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
HOXD11P31277 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235 ms