Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 STAT6-203ENST00000537215 2886 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 DCAF4L1-201ENST00000333141 4772 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ESR2-208ENST00000554572 3588 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 MEF2C-229ENST00000627659 2393 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 GABRR1-203ENST00000454853 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SPIDR-206ENST00000518074 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 PCNX4-204ENST00000406949 3513 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 R3HDM2-202ENST00000358907 3974 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 BTG1-201ENST00000256015 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ENPP4-201ENST00000321037 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 LACTB2-AS1-201ENST00000499227 3716 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TIPARP-202ENST00000461166 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 NPAP1P6-201ENST00000440671 3484 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 HKDC1-201ENST00000354624 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 IMMT-202ENST00000409051 2515 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SEMA4A-203ENST00000368284 2981 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SSFA2-203ENST00000409136 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 LYPD6-201ENST00000334166 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SCN5A-205ENST00000423572 8362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 WDR82-201ENST00000296490 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 NMT2-202ENST00000378165 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 AL160286.1-201ENST00000427215 2471 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 MMP2-202ENST00000437642 2469 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 PER3-202ENST00000377532 6279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ITSN1-211ENST00000399355 4003 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 RAMP2-AS1-205ENST00000592670 3118 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 EXD2-206ENST00000409949 2688 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 PMEL-204ENST00000548493 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 KLC2-202ENST00000394065 3755 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TXNL1-201ENST00000217515 6894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CEACAM5-201ENST00000221992 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CLDN19-201ENST00000296387 2859 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 COL5A2-203ENST00000618828 6399 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 HMGB1-206ENST00000405805 4199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 KLHL30-201ENST00000409223 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 MAPKBP1-202ENST00000457542 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 L1CAM-202ENST00000361981 5004 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ATP8A2-201ENST00000255283 3287 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 PITRM1-202ENST00000380989 3487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC00909-202ENST00000580048 3463 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SNX16-202ENST00000353788 3032 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CACNB3-204ENST00000547230 2395 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 PTPRK-205ENST00000368213 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM198B-202ENST00000393807 4544 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 RHO-201ENST00000296271 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TMEM164-202ENST00000372068 5566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TGM5-201ENST00000220420 2767 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 VPS33B-201ENST00000333371 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 EIF1AD-204ENST00000526451 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 TGM5-205ENST00000610827 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 RCHY1-201ENST00000324439 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 SERHL2-202ENST00000335879 753 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 OR2S2-201ENST00000341959 1047 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 RNA5SP370-201ENST00000362545 121 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP4-2Q9BYR5 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.7 ms