Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LILRB1-205ENST00000396331 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNQ3-201ENST00000388996 11510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LIFR-AS1-201ENST00000500733 3803 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TNFAIP3-208ENST00000615468 3818 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SSRP1-201ENST00000278412 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM86EP-201ENST00000313946 2845 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP11B1-204ENST00000517471 1874 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SEPT3-202ENST00000396425 4649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FSD2-201ENST00000334574 6418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DOCK6-201ENST00000294618 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NUDT4-206ENST00000549992 3607 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BAHD1-201ENST00000416165 4526 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP7B-203ENST00000400366 6304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GPLD1-201ENST00000230036 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SRSF10-204ENST00000344989 3487 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CTCFL-202ENST00000371196 3491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ERCC5-201ENST00000355739 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NAT10-210ENST00000615292 3329 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF2-203ENST00000361247 4149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SUN2-202ENST00000405510 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM225B-201ENST00000423546 5629 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PADI6-201ENST00000619609 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GFOD2-202ENST00000602279 5507 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CELF2-202ENST00000399850 7085 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 HSPA5-201ENST00000324460 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LEPROT-201ENST00000371065 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GDNF-AS1-205ENST00000637926 3819 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 BIRC2-201ENST00000227758 3743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 WDHD1-202ENST00000420358 3722 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 LNX1-201ENST00000263925 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF384-203ENST00000361959 2978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FPGT-TNNI3K-206ENST00000557284 2855 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR33-202ENST00000393006 3574 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PDSS2-202ENST00000369037 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM37-202ENST00000393065 3548 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 ASPH-208ENST00000517856 6337 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CNGA3-201ENST00000272602 3470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 CELF2-209ENST00000631460 5538 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP4-12Q9BQ66 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.4 ms