Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 SYT1-212ENST00000552744 2718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 GM2A-201ENST00000357164 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 SLC4A8-203ENST00000453097 11824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ADGRE4P-202ENST00000600751 2810 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 SOD2-211ENST00000538183 14266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 SLC36A2-201ENST00000335244 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
HOXA2O43364 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 XRCC6P5-201ENST00000435236 1795 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AC006213.1-202ENST00000589021 2176 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 KCTD6-201ENST00000355076 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 ACKR2-202ENST00000442925 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 TTC21A-203ENST00000431162 4209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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HOXA2O43364 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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HOXA2O43364 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
HOXA2O43364 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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