Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6I8

PXMP4, Peroxisomal membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXMP4Q9Y6I8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXMP4Q9Y6I8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms