Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AUP1Q9Y679 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms