Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFG3L2Q9Y4W6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms