Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RCE1Q9Y256 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms