Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
THSD7AQ9UPZ6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
THSD7AQ9UPZ6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
THSD7AQ9UPZ6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
THSD7AQ9UPZ6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
THSD7AQ9UPZ6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THSD7AQ9UPZ6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THSD7AQ9UPZ6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THSD7AQ9UPZ6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THSD7AQ9UPZ6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THSD7AQ9UPZ6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THSD7AQ9UPZ6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THSD7AQ9UPZ6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
THSD7AQ9UPZ6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
THSD7AQ9UPZ6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THSD7AQ9UPZ6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THSD7AQ9UPZ6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
THSD7AQ9UPZ6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THSD7AQ9UPZ6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
THSD7AQ9UPZ6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THSD7AQ9UPZ6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THSD7AQ9UPZ6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THSD7AQ9UPZ6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
THSD7AQ9UPZ6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms