Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMG5Q9UPR3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms