Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NRXN1Q9ULB1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NRXN1Q9ULB1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms